Придя к Цитре, она даст напиток. Выпив его будет ряд галлюцинаций, первая — начинаете падать и видите остров — отсылка к десантированию в CRYSIS (залив даже внешне похож с аналогичным)
В самом начале игры в хижине где нужно взять карту планшет и телефон висит портрет Цитры
Если приглядется на нашего друга Уиллиса Хантли, то он очень похож на Хадсона из Call of Duty Black Ops (Только с волосами). И очень страное совпадение, что они оба из ЦРУ
В 32 миссии у тебя задание спуститься в подвал и допросить заключенного. Спускаясь по лестнице видим сидящего справа охранника, который смотрит по телику видео, как ты и твои друзья попадают в плен
На острове присутствуют разные виды животных, которые не могли бы жить на острове, в т.ч. и Белый Медведь, это отсылка к сериалу LOST.
В начале игры, когда после неудачной попытки побега Джейсон получает от Вааса 30 секунд на то, чтобы скрыться в джунглях, тот кричит: «Беги, Форест, беги!» — это отсылка к фильму Форрест Гамп.
В игре есть дополнительное задание, где женщина рассказывает об упавшем самолете, что является отсылкой к LOST.
В DLC «Забытые экспедиции» есть бункер, в котором на стенах присутствуют знаки Абстерго. А так—же пройдя бункер до конца можно узнать о экспериментах с генетической памятью. Вообще игра очень похожа на Assassin Creed: вышки, аванпосты, быстрые убийства ножом, предметы сбора, главному герой даже безыменный палец отрезают, как Альтаиру — герою первой Assassin Creed.
В Far Cry 3 и Assassin's Creed 3 игра начинается с фразы из "Алисы в стране чудес" от том что она прыгнула не думая сможет ли выбратся обратно. В AC3 фразу говорит Шон когда они входят в "убежище" Предтеч а в FC3 надпись появляется на екране в самом начале.
В одной из миссий DLC — "Пропавшая экспедиция", когда герою приходится быстро и много подниматься по лестнице, он говорит: "Да, мне бы сейчас пригодился портал", что является очевидной отсылкой к игре Portal
В одной из миссий, главному герою предстоит спустится в старый бункер, оставшийся со 2 мировой. Буквально на входе, на стенах бункера, нас встречает знакомый символ в виде составного треугольника — это символ компании Abstergo Industries, принадлежащей Тамплиерам, из всем известной серии — Assassin's Creed
Игра заняла второе место в номинации "Лучшая игра 2012 года" по версии журнала "Игромания"
Уиллис Хантли, улетая в Россию, говорит, что спецоперация ОТГ—141 идёт полным ходом, что является отсылкой к серии игр Call of Duty: Modern Warfare
На острове можно найти голову Кристофера Чарльза Минц—Плассе на одном из побережий огромного архипелага. Пасхалка стала доступна после завершения цикла сериала FAR CRY EXPERIENCE
Собрав всех друзей в пещере под особняком доктора Эрнхардта, можно, приняв спрятанные таблетки, очутиться в галлюцинации, где Джейсон и друзья проводят время в ночном клубе.
Когда доктор Эрнхардт посылает главного героя за лекарством для Дэйзи в пещеру, Джейсон, перед тем, как прыгнуть с уступа, произносит: "прыжок веры". Это отсылка к серии Assassin's Creed, разработчиком которой также является Ubisoft Montreal
Это уже вторая игра в серии, в которой нету главного героя первой части — Джека Карвера. Игроки так и не узнали, что случилось с ним в конце игры
В доме доктора Эрнхадта есть пачки сигарет с надписью Russian vodka
В одной из первых миссий, перед тем как прыгнуть он скажет "Прыжок веры" явная отсылка на AC